Il principale obiettivo di questa tesi è sviluppare un sistema efficace e robusto per tracciare organoidi tridimensionali nel tempo, estrapolando pattern biologici significativi in modo affidabile. Monitorare la crescita e l'evoluzione morfologica degli organoidi è cruciale per comprendere i meccanismi biologici sottostanti, ma la qualità delle immagini OCT utilizzate a questo scopo pone sfide tecniche considerevoli. Le immagini di tomografia a coerenza ottica (OCT), infatti, risultano rumorose, con livelli di disturbo che rendono difficile isolare i dettagli utili dagli artefatti di segmentazione. Inoltre, queste immagini risultano non registrate, causando discrepanze di orientamento o scala tra i vari volumi e complicando l’identificazione di pattern e cambiamenti degli organoidi.