La gestione ed il trattamento delle acque reflue nei rifugi alpini dipendono da molteplici fattori che presentano considerevoli problematiche rispetto alla depurazione effettuata in zone urbane. I rifugi montani sono infatti piccole utenze molto spesso isolate, con difficoltà di approvvigionamento idrico ed energetico, aventi ridotti spazi a disposizione e gestiti in maniera discontinua nell'arco dell'anno. Inoltre, il trattamento delle acque reflue è soggetto a basse temperature che ne abbassano le rese depurative, ed i sistemi presenti sono nel tempo sottoposti a forti differenze di carico idraulico ed inquinante a causa della variazione dei flussi turistici. I principali parametri che entrano in gioco nella scelta dell'idoneo trattamento sono la quota di ubicazione e gli abitanti serviti, esprimibili in funzione dei posti letto della struttura.